Steen实验室|实验室成员

Judith Steen博士她是哈佛医学院神经生物学副教授，哈佛干细胞研究所成员，波士顿儿童医院F. M. Kirby神经科学中心神经蛋白质组学实验室主任。欧宝彩票平台她的实验室致力于使用系统生物学方法了解神经再生和神经退行性疾病。该实验室在蛋白质组学和转录组学的界面上开发新的定性和定量方法，特别强调计算蛋白质组学方法。Steen实验室开发的这些新的定量方法和生物信息学工具正被用于理解小鼠模型、干细胞和人类组织中的再生和神经退行性变生物学，寻找治疗的分子靶点，并识别神经退行性变过程的生物标志物。利用生物化学、分子和细胞生物学方法进行进一步的功能研究，以验证和了解靶点和生物标记物在损伤和疾病中的作用。本研究的目的是利用定量蛋白质组学测量提供的分子信息来改善神经退行性变和促进再生。judith.steen@childrens.harvard.edu

汉诺·斯蒂恩博士他是哈佛医学院病理学副教授，其实验室位于波士顿儿童医院。欧宝彩票平台Steen博士的小组研究有三个重点领域:

i)发现用于诊断各种急慢性疾病的尿生物标记物，包括阑尾炎、川崎病、结核病、创伤性脑损伤和克罗恩病。为此，Steen实验室开发了一个尿液蛋白质组学平台，可以对尿液标本进行快速有效的处理和蛋白质组学分析。

ii)利用蛋白质组学研究蛋白质调控的翻译后机制，重点研究有丝分裂和发育过程中的蛋白质降解。Steen团队开发了协同调节蛋白质组学算法的概念，该算法将蛋白质丰度与特定酶活性和功能相关联。这项工作的结果是确定了kinens，作为一种新的细胞周期依赖底物的后期促进复合物。

iii)方法开发，以改进a)蛋白质组样本的处理，b)蛋白质定量的准确性和精密度，iii)蛋白质组数据定性和定量分析的计算方法。例如，Steen实验室开发的FLEXIQuant方法允许对所选蛋白质及其翻译后修饰进行细致的描述，已经成为研究多激酶机制的工具(Nat Methods. 2012;9:504)，以及Xenopus发育过程中Tiki1的翻译后调控(Cell. 2012;149:1565)和有丝分裂过程中C1的kinesin (EMBO J. 2014;33:385)。hanno.steen@childrens.harvard.edu

Ceren Uncu来自土耳其安塔利亚。她毕业于伊斯坦布尔大学。在高中教了一年生物之后，她决定搬到美国，并在2011年成为Steen实验室的一员。她目前是Steen实验室的实验室主管和动物外科医生。除了管理实验室，Ceren还致力于开发新的小鼠模型，以更好地了解神经退行性疾病，如脊髓性肌肉萎缩症、阿尔茨海默病和帕金森病，她正在为质谱分析准备样本。在实验室外，Ceren练习并教授瑜伽，并喜欢与朋友和家人一起烹饪。ceren.uncu@childrens.harvard.edu

程龙，哈佛医学院神经学讲师，Steen实验室高级科学家和实验室经理。他获得博士学位，曾在北京中医药大学和清华大学接受培训。他的研究重点是脑损伤和疾病中的神经干细胞的神经生物学，以及人类神经疾病和癌症背后的几种细胞信号通路的分子机制。2006年底，他加入波士顿儿童医院和哈佛医学院，担任博士后研究员，研究神经生物学和运动神经元发育性疾病、神经退行性和再生的机制。自2017年以来，他成为Steen实验室的团队成员，一直致力于功能研究，试图将实验室中的蛋白质组学发现转化为人类神经退行性疾病的神经生物学和分子机制。他喜欢烹饪、听音乐、听广播、和朋友踢足球、和家人一起旅行。他非常喜欢为他的家人和朋友做美味的食物。long.cheng@childrens.harvard.edu

Meenakshi Jha在印度出生和长大。她毕业于印度班加罗尔大学生物技术专业。研究生毕业后，她在安永会计师事务所工作。她于2018年1月移居美国。她对科学的兴趣使她将自己的职业转向了科学，并最终在2018年5月获得了加入Steen实验室作为研究助理的机会。目前，她正在探索定量蛋白质组学的不同方面。她喜欢音乐，唱歌是她最喜欢的消遣。她还喜欢旅行和探索世界各地的新地方。meenakshi.jha@childrens.harvard.edu

Christoph Schlaffner在德国出生和长大。他毕业于上奥地利应用科学大学(University of Applied Sciences)，获得工程学士学位(生物信息学)和工程硕士学位(生物信息学)。他继续在英国剑桥大学获得博士学位，在那里他与维康信托桑格研究所的Jyoti Choudhary博士和剑桥大学分子信息学中心的Andreas Bender博士合作，开发蛋白质基因组学和个人蛋白质组学的工具和分析数据。Christoph对开发生物信息学工具感兴趣，以了解非规范RNA和翻译产物的功能，并解开与个人变异相关的疾病。在实验室之外，Christoph喜欢烹饪和烘焙，旅行和合唱音乐。christoph.schlaffner@childrens.harvard.edu

Pieter Beerepoot毕业于加拿大麦克马斯特大学生物与药理学专业。他在加拿大多伦多大学药学系继续接受药理学的培训，在那里他致力于小分子方法挽救神经疾病背景下的膜蛋白折叠。Pieter主要专注于神经科学领域的治疗学发展，并正在寻求将质谱蛋白质组学作为目标发现工具的培训。目前，Pieter正在描述与神经退行性疾病慢性创伤性脑病(CTE)相关的蛋白质组学变化。CTE是一种由创伤性脑损伤引起的毁灭性疾病，在接触性体育运动员和军事人员的死后被诊断出来。目前还没有方法来诊断患有CTE的活着的个体，因此Pieter专注于识别潜在的生物标志物。Pieter还从事翻译后修饰的鉴定，这些修饰可以作为神经退行性变领域抗体开发的靶点。似乎质谱分析还不够令人兴奋，Pieter用攀岩、登山自行车、武术和耐力运动填补了他的空闲时间。pieter.beerepoot@childrens.harvard.edu

熊英毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所。博士期间，她专注于通过基因筛选识别与阿尔茨海默病和其他牛油病中tau蛋白聚集相关的异常表型抑制因子。她以博士后的身份加入了Steen 's实验室，试图通过蛋白质组学来了解另一组神经退行性疾病的病理机制和识别潜在的生物标志物——共核病。莹喜欢音乐，喜欢与朋友和家人在一起。ying.xiong@childrens.harvard.edu

Saima Ahmed于2016年毕业于哈佛扩展学院，获得生物技术硕士学位。她在Hanno Steen博士的指导下完成了她的硕士论文“使用基于尿液蛋白质组学的质谱法发现支气管肺发育不良的生物标志物”。她对斯蒂恩实验室的喜爱是如此强烈，以至于她决定在这个实验室攻读博士学位。她的项目包括改进生物标志物发现的蛋白质组工作流程，以及研究人体脑脊液和尿液等体液的磷蛋白质组。她还将分析婴儿大脑的蛋白质组，希望了解脑损伤造成的病理生理影响。Saima对粉色的热爱影响了她生活的方方面面，包括她的实验室长凳。saima.ahmed@childrens.harvard.edu

Benoit Fatou在法国里尔大学获得了物理学和生物学博士学位，专注于开发一种基于质谱的实时引导癌症手术的新型仪器。获得博士学位后，他用一年的时间进行了他的第一次博士后培训，研究的项目与他完成论文的实验室相同。法图博士现在是波士顿儿童医院/哈佛医学院PI Dr. H. Steen的博士后研究员。欧宝彩票平台他的研究重点是开发和应用靶向和定量蛋白质组学方法发现神经退行性疾病的生物标志物。工作之余，伯努瓦喜欢花一些时间做饭，夏天钓鱼，冬天滑雪。benoit.fatou@childrens.harvard.edu

Mukesh Kumar于2017年10月加入Steen实验室，担任博士后。他在德国德累斯顿的马克斯普朗克分子细胞生物学和遗传学研究所(MPI-CBG)的Andrej Shevchenko博士的实验室完成了他的博士工作。目前，在实验室中，他正在使用他最喜欢的定量质谱法来了解蛋白质(丰度、聚集、翻译后修饰等)在神经退行性变中的作用。在业余时间，他喜欢骑自行车、做饭、打板球和睡觉。mukesh.kumar@childrens.harvard.edu

Kathrin Wenger曾在德国留学，并于德国艾伦大学获得分析与生物分析化学硕士学位。由于她对质谱、生物化学和多元数据集的统计数据分析感兴趣，她决定在2019年加入Steen实验室攻读博士学位。她的项目包括将不同的阿尔茨海默病小鼠模型与人类样本进行比较，以确定进一步研究的最佳匹配模型。闲暇时，凯瑟琳喜欢徒步旅行、攀岩、编织和烹饪。kathrin.wenger@childrens.harvard.edu

Eva-Maria Schneeberger在奥地利因斯布鲁克大学有机化学研究所获得化学博士学位后，于2018年10月加入Steen实验室，担任博士后。作为Kathrin Breuker博士研究小组的研究生，她开发了RNA、蛋白质和多肽中癌价分子内和分子间相互作用的表征方法，通过原生自上而下的质谱分析，这激发了她将其广泛的专业知识结合到生物学背景中的兴趣。在Steen实验室，Eva-Maria将她的自顶向下质谱背景应用到与神经退行性疾病相关的完整蛋白质的翻译后修饰(PTMs)的阐明。作为这项工作的补充，她正在扩展她的知识，并学习自下而上蛋白质组学的工作流程。通过结合两种方法，她的目标是了解神经退行性疾病的PTM模式，从而可以作为治疗的靶点。在实验室之外，Eva-Maria喜欢探索户外的新地方，不管距离远近，她也喜欢徒步旅行。Eva-Maria.Schneeberger@childrens.harvard.edu

Anaïs Meziani于2017年以学生身份加入Steen实验室，完成她的硕士课程。她毕业于法国里尔大学生物化学学士学位。她在里尔继续攻读基因组学和蛋白质组学硕士学位。2018年10月Anaïs在实验室开始写博士论文。Anaïs喜欢团队运动如手球和爱吃芒果从墨西哥!anais.meziani@childrens.harvard.edu

Michaela Svrdlikova出生在捷克共和国。她拥有荷兰马斯特里赫特大学的认知和临床神经科学硕士学位。她的硕士学位专门研究中枢神经系统疾病的药物发现课题。她在Steen实验室进行了硕士实习，学习了蛋白质组学和质谱学方面的知识。在实习期间，她非常喜欢实验室的工作和氛围，因此当她获得Steen实验室的博士学位邀请时，她非常高兴。她正在研究tau蛋白在阿尔茨海默病和慢性创伤性脑病(CTE)中的作用。她特别关注tau蛋白降解的各个方面。在她的空闲时间，她喜欢滑雪，徒步旅行，跑步或骑自行车。michaela.svrdlikova@childrens.harvard.edu

Sinead Greally毕业于爱尔兰戈尔韦国立大学的生物医学理学学士学位，由于她对药理学和神经科学感兴趣，她继续在荷兰马斯特里赫特大学的药物开发和神经健康研究硕士学位学习。在硕士的第二年，Greally女士在Steen实验室进行了9个月的实习，与Ying Xiong博士合作，使用质谱和蛋白质组学来表征和量化神经退行性疾病多系统萎缩(MSA)中的α -突触核蛋白。Greally女士在马斯特里赫特大学(Maastricht University)获得硕士学位后，回到Steen实验室开始攻读博士学位，继续她在α -突触核蛋白蛋白质组学表征方面的工作，目前在MSA和帕金森病方面都有研究。在攻读博士学位的同时，Sinead很享受波士顿的美国文化，喜欢旅游、看电影和和朋友出去玩。sinead.greally@childrens.harvard.edu

Lucrezia Favi在fossombroone出生并长大。她对科学的热爱源于解开科学的复杂性，尤其是在神经退行性疾病领域。加上对旅行的热情，卢克雷齐亚的兴趣首先把她带到了伦敦，在那里她提高了自己的英语水平。接下来，她搬到了荷兰，在莱顿大学以优异成绩完成了心理学学士学位。在她对神经科学的热情驱使下，她在马斯特里赫特大学开始了认知和临床神经科学研究硕士课程，主修基础神经科学。作为硕士教育的一部分，她目前在Steen实验室完成她的硕士论文实习。在这里，她专注于蛋白质组的改变和Tau蛋白在牛皮病中的翻译后修饰，并研究这些发现在人类发病机制中的功能作用与细胞模型。完成硕士学位后，Lucrezia计划在实验室开始她的博士学位。除了致力于揭开神经退行性疾病背后的神秘面纱外，Lucrezia尽她所能地周游世界。她还积极地练习从舞蹈到空中飞人的各种运动，与此同时，她从未忘记她的意大利根活着的起源和她对烹饪的热爱。lucrezia.favi@childrens.harvard.edu

帕特里克·w·范·扎尔姆在荷兰出生和长大。他在阿姆斯特丹大学开始了他的学术训练，在那里他完成了心理生物学的学士课程。他仍然对神经科学感兴趣，在马斯特里赫特大学继续他的学术训练，在那里他完成了认知和临床神经科学的硕士课程，专业是药物开发和神经健康。在他的硕士课程期间，Patrick加入Steen实验室，因为他对神经退行性疾病感兴趣。在他的硕士项目中，帕特里克专注于在阿尔茨海默病的体液中寻找新的生物标记物。Patrick将继续他在Steen实验室的博士生工作，在那里他将继续他在不同神经退行性疾病体液中的生物标志物发现和验证的工作。除了在实验室工作之外，帕特里克还努力通过去健身房或跑步来保持健康。他还喜欢去听音乐会、参加音乐节，并探索波士顿令人兴奋的啤酒厂文化。Patrick.vanZalm@childrens.harvard.edu

凯尔·希金斯在美国里海大学获得物理学学士学位。在此期间，他与布鲁克海文国家实验室合作研究了高能强子碰撞实验。这项工作包括设计和建造一个用于识别碰撞产物的光纤闪烁探测器，并对实验探测器数据进行计算分析。Kyle于2019年开始在Steen实验室担任生物信息学领域的研究助理，他正在应用统计和算法技术将有关单核苷酸多态性(SNPs)的数据与基因组和转录组参考序列集成，以更好地理解其产生的蛋白质组。此外，他还负责管理实验室的数据存储和传输。kyle.higgins@childrens.harvard.edu

Zainab Wurie于2017年2月加入Steen实验室，担任本科研究员，她的毕业论文主要研究人类脑脊液肽组学方法优化和质谱分析。她于2018年毕业于哈佛大学神经生物学学士学位。她非常喜欢这个实验室，于是决定全职加入。作为研究助理，她在Benoit Fatou博士手下工作，进行血浆和血清样本处理，用于蛋白质组学/质谱分析，以及蛋白质组学/肽组学方法优化。在实验室之外，她喜欢长时间散步，看有趣的YouTube视频，和朋友和家人在一起。zainab.wurie@childrens.harvard.edu

Konstantin Kahnert很早就对自然科学产生了浓厚的兴趣，在高中(Abitur)就已经专注于化学和生物。在柏林理工学院(Berlin Institute of Technology)攻读生物技术学士学位期间，他发现了自己对蛋白质组学的热情。在意识到MS数据的生物信息学分析是蛋白质组学研究中最大的挑战之一后，他在硕士期间专注于生物信息学、数据分析和机器学习。加上他对神经退行性疾病的普遍兴趣，这使他非常适合Steen实验室，他现在正在那里进行他的硕士论文项目。虽然康斯坦丁不是坐在电脑前写代码和分析数据，但他喜欢在户外做各种运动，尤其是骑自行车、徒步旅行和举重。konstantin.kahnert@childrens.harvard.edu