炎症性肠病中心
波士顿儿童医院炎症性肠病中心，由Richard Grand博士指导，是一个综合的，多学科的研究，教学和护理项目，旨在解决儿童发病炎症性肠病(IBD)的独特特点。该中心由七个核心项目组成:上皮细胞和分子生物学基础研究和免疫反应的分子生物学、临床研究、药理学、营养学、癌症生物学和监测、结果研究和卫生保健政策。中心活动的目标是促进儿童医院目前在IBD相关领域工作的调查单位之间的互动，并在尚未研究IBD的实验室启动新项目。除了数据会议和会议已经在各个实验室进行，每个星期三下午的两次会议集中讨论中心的项目、协议和计划，它为研究员和工作人员提供了一个积极参与IBD研究的机会。该中心部分由核心设施和哈佛儿童医院消化疾病中心(PI: Wayne I. Lencer博士)的试点可行性资金支持。
乳糜泻项目和支持小组
波士顿儿童医院的乳糜泻项目提供乳糜泻的诊断和治疗。我们的专家是国内最好的一些在诊断和帮助家庭控制乳糜泻无麸质生活方式。我们还有一个家庭支持小组和Celiac家庭健康教育资源。
乳糜泻是一种自身免疫性疾病，会导致小肠受损，使其无法正确吸收食物和营养。乳糜泻可以通过长期无麸质饮食来治疗。
胃肠运动和功能性疾病中心
波士顿儿童医院的运动中心是消化内科的一个亚专科项目。我们的使命是为患有运动性和功能性肠道疾病的儿童及其家人提供最先进的护理和评估。我们评估和处理婴儿、儿童、青少年和青壮年由于胃肠道运动或感觉异常引起的各种疾病。有运动障碍的病人从新英格兰，美国和世界各地转到我们的中心。该中心还有一个很大的教育和研究部门。
胃肠病学过程单元
胃肠病学程序单元(GPU)是一个全方位服务单元，提供一系列诊断和治疗内镜程序在一个安全，舒适的环境。
我们的专家团队与医院其他科室紧密合作，及时提供日常和紧急护理。患者通常通过胃肠病学、肝病学和营养学分部被推荐到GPU。
消化系统疾病治疗项目被评为全国最好的ob 游戏 ．
肝脏移植程序
波士顿儿童医院的儿科肝移植项目评估有可能接受肝移植的儿童，并管理接受肝移植的儿童的护理。肝脏移植是指用他人的健康肝脏替换患病肝脏的手术。
自1984年该项目成立以来，Children's已经进行了超过140例肝脏移植，并在死亡的全器官移植、缩小肝移植、分割肝移植和相关的活体供体移植方面提供专业知识。
大小便节制中心
波士顿儿童医院的排尿和肠道控制(CUB)项目是一个独特的多学科项目，旨在协调先天性畸形(如肛肠、脊髓、神经肌肉或泌尿系统畸形)导致的排尿和肠道失禁儿童的护理。
“幼童计划”采用多学科的方法来治疗这些复杂的问题，这通常需要一个孩子同时接受许多专家的护理。
通过CUB计划，每个患者都由来自不同科室的专家团队进行评估，包括消化内科、普外科、神经外科和泌尿科，所有这些都在一次访问中完成。其他部门，如行为医学，放射学和骨科，也经常咨询。然后，专家们集体会面，对儿童进行评估、诊断和评估，并实施一个多层面的护理计划，满足每个患者的需求，确保每个儿童得到最高水平的护理。提供最先进的诊断测试和治疗方法。在阑尾造口患儿的治疗和随访方面，幼兽计划有着丰富的经验。
临床营养服务
波士顿儿童医院的临床营养服务(CNS)为所有年龄的住院和门诊病人提供全面的营养咨询服务。我们的工作人员利用创新的诊断和评估技术，为患有各种疾病的婴儿、儿童和青少年制定适当的营养计划。
生长与营养计划
儿童成长与营养计划成立于1984年7月。这是该国首批解决儿童营养不良问题的多学科团队项目之一，以前被称为“成长失败”。我们目前的增长和营养计划已经连续运行了23年，取得了巨大的成功。我们的项目通过与公共卫生部的一项合同得到支持，该合同为马萨诸塞州的特定生长和营养网站提供资金。
航空消化系统疾病中心
空气消化系统疾病中心(CADD)为患有复杂的呼吸道、肺部和上消化道疾病的儿童提供长期护理和最先进的医疗和手术治疗。
该中心由来自不同领域的多学科专家组成，提供全面的评估、治疗和随访。
高级肠道康复中心
波士顿儿童医院的高级肠道康复中心(CAIR)是世界上治疗短肠综合征的主要项目之一，短肠综合征是一种复杂的，往往是毁灭性的疾病，由失去部分小肠引起。治疗方案可能包括营养管理、医疗服务或手术服务。
肠和多器官移植计划
波士顿儿童医院的肠和多器官移植项目评估小肠移植、小肠/肝移植和多器官移植的潜在候选儿童，并管理接受这些移植的儿童的护理。
多脏器移植是指对胃、胰腺、肝脏和小肠等多个器官进行移植的手术。
普通临床研究中心(GCRC)
普通临床研究中心自1964年以来一直由美国国立卫生研究院资助，是波士顿儿童医院临床研究的中心。其使命是为多学科临床研究提供一个最佳的设置，从而确保及时将科学知识转化为有效的患者护理。GCRC位于CHB校园主楼(东6号)的中心位置，是一个有八个床位的单位，旨在支持参与临床研究的儿童的护理。所有的病房都有一个家长和他们的孩子过夜的地方。该单元拥有设备齐全的治疗室、药物室、游戏活动区、餐厅和营养中心。支持我们协议需求的代谢厨房也位于东6号。用于门诊研究访问的门诊GCRC位于第6号馆的住院部附近。GCRC提供的支持包括核心实验室、信息学、生物统计学、营养学和表型/基因型核心项目。
目前，GCRC支持140个活跃的协议，涉及代表医院21个部门的75名不同的研究人员。在培训和指导年轻临床研究人员方面有很大的努力。